More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003049 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 		 427 aa  867    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  88.06 
 
 		 427 aa  778    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  61.97 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.84 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  26.33 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.44 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.4 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  26.38 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.9 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  26.28 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.83 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.94 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.87 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.33 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  27.02 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.53 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.92 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.84 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  27.02 
 
 		 424 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.96 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.63 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.65 
 
 		 656 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.7 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  27.38 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  26.14 
 
 		 668 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  26.46 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  26.46 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  30.75 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.53 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  27.53 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.12 
 
 		 648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.04 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.94 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.82 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.34 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  26.1 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  25.76 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  25.47 
 
 		 657 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  26.1 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.18 
 
 		 643 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.22 
 
 		 653 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  26.57 
 
 		 670 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.39 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.38 
 
 		 394 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  24.77 
 
 		 409 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  22.63 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.01 
 
 		 648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  25.47 
 
 		 647 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.01 
 
 		 648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  30.11 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.01 
 
 		 648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.78 
 
 		 648 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  25.42 
 
 		 648 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  30.52 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  25.42 
 
 		 648 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.99 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  27.44 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  25.81 
 
 		 657 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.46 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.42 
 
 		 411 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.21 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 		 654 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.22 
 
 		 642 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.55 
 
 		 657 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.23 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.78 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.8 
 
 		 641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.8 
 
 		 657 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  23.37 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  24.94 
 
 		 655 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  25.06 
 
 		 653 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  25.06 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.78 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  30.16 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.41 
 
 		 647 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  26.97 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>