More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002560 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  92.69 
 
 		 300 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  81.1 
 
 		 293 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  75.96 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  63.74 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  63.74 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  62.55 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  63 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  63.37 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  65.91 
 
 		 284 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  60 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  60.73 
 
 		 284 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  59.71 
 
 		 284 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  59.34 
 
 		 284 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  59.34 
 
 		 284 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  59.34 
 
 		 284 aa  344  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  58.97 
 
 		 284 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  58.97 
 
 		 284 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  57.2 
 
 		 289 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  57.88 
 
 		 283 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  57.51 
 
 		 283 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  57.51 
 
 		 283 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  55.23 
 
 		 284 aa  316  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  52.61 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  56.58 
 
 		 281 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  54.15 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  56.68 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  56.32 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  53.55 
 
 		 283 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 281 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  55.52 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 		 285 aa  301  8.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  55.52 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  54.45 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 282 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  56.18 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 287 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 282 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  51.62 
 
 		 282 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.42 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 283 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 287 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  53.43 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  50.35 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  46.81 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 286 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  50.99 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.29 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 309 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.32 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.42 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.65 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>