More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0791 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  74.91 
 
 		 268 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  74.16 
 
 		 268 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  75.28 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  66.29 
 
 		 269 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  64.42 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  358  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  65.04 
 
 		 269 aa  357  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  64.77 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  69.43 
 
 		 278 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  69.06 
 
 		 273 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  69.06 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  69.7 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 278 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  67.55 
 
 		 267 aa  345  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 		 272 aa  345  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 268 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  68.18 
 
 		 278 aa  344  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  67.05 
 
 		 269 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  68.94 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  68.3 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  68.94 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  68.8 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  64.42 
 
 		 269 aa  334  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  331  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  63.3 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  62.92 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  62.92 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  63.16 
 
 		 268 aa  328  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  64.04 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  63.7 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  58.67 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  58.08 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  58.27 
 
 		 280 aa  284  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  38.4 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  36.98 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  37.36 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  37.74 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.23 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.25 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  41.63 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  34.46 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  34.8 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.75 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.71 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.27 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  37.86 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 268 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.14 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  35.85 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>