More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4119 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 476 aa  981    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  82.03 
 
 		 474 aa  820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.03 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  64.03 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.03 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.96 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.74 
 
 		 463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  62.47 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  58.41 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  50.43 
 
 		 481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  43.59 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.01 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  39.78 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  39.9 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  34.33 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  35.19 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 433 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.4 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.13 
 
 		 433 aa  236  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  36.32 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  34.05 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  33.6 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 		 432 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.6 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  31.91 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.18 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  32.47 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.91 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  32.67 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  33.94 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  35.8 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.11 
 
 		 440 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  34.7 
 
 		 442 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  35.57 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.81 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  34.43 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  31.67 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.53 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  34.74 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.25 
 
 		 441 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  34.49 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.76 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  28.31 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.39 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.22 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.87 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.63 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.76 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.63 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  20.19 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.22 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.63 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.63 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  23.33 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.38 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.43 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  23.31 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  25.11 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 462 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  22.3 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  30.23 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  34.93 
 
 		 1067 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  27.49 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.11 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.19 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  24.01 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1017 aa  60.1  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.78 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  31.08 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 		 1023 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  29.21 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.21 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.41 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  21.95 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  34.81 
 
 		 973 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  29.03 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  29.03 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  22.38 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.68 
 
 		 1013 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  27.37 
 
 		 572 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.15 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>