More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3473 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 323 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  42.28 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.75 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  31.61 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  28.95 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  34.67 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  24.64 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  20.95 
 
 		 290 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 296 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.71 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  22.96 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  37.38 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  23.87 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 246 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.54 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.43 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  36.17 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  26.96 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  32.43 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  32 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.11 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 277 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 277 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 277 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  22.09 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.78 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.78 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  23.94 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.78 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  32 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  30.93 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.71 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>