94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2687 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  71.43 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  62.22 
 
 
94 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  58.89 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.78 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
91 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 
94 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 
91 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 
93 aa  106  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 
93 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
95 aa  104  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 
93 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  55.56 
 
 
95 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 
92 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
92 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  52.22 
 
 
92 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 
95 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  54.44 
 
 
94 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
95 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
93 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.11 
 
 
92 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  52.22 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
93 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
93 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
93 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  54.44 
 
 
93 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.1 
 
 
81 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  40.68 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.74 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  38.6 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
104 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
85 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  30.65 
 
 
78 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 
164 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
78 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  27.5 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  27.96 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.77 
 
 
77 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
78 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>