More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2675 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  100 
 
 
314 aa  623  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  62.58 
 
 
325 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  63.96 
 
 
354 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  58.17 
 
 
313 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  53.95 
 
 
314 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  45.81 
 
 
352 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  43.91 
 
 
342 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  45.11 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  45.05 
 
 
313 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  45.69 
 
 
361 aa  232  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  44.23 
 
 
314 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  39.3 
 
 
314 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  43.59 
 
 
314 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  42.9 
 
 
323 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  42.01 
 
 
360 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  40.06 
 
 
314 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  41.21 
 
 
315 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  43.31 
 
 
313 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  43.55 
 
 
329 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  45.08 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  42.54 
 
 
330 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  41.46 
 
 
313 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  43.09 
 
 
312 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  42.04 
 
 
312 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  41.46 
 
 
311 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  39.56 
 
 
320 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  38.73 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  40.95 
 
 
314 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  39.94 
 
 
363 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  40.38 
 
 
363 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  42.27 
 
 
315 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  40.89 
 
 
315 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  40.58 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  43.27 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  33.97 
 
 
312 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.97 
 
 
315 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.75 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.85 
 
 
318 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.65 
 
 
312 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  30.03 
 
 
300 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.33 
 
 
328 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.06 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.06 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.94 
 
 
408 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.5 
 
 
322 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.13 
 
 
313 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  36.94 
 
 
319 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.06 
 
 
321 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  33.23 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.29 
 
 
347 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.28 
 
 
323 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.76 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.45 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  36.08 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.03 
 
 
313 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.7 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.44 
 
 
317 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.94 
 
 
317 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.96 
 
 
316 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  31.15 
 
 
322 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.03 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.08 
 
 
396 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.8 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.94 
 
 
409 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  34.8 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.06 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.94 
 
 
321 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  30.09 
 
 
401 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  28.88 
 
 
323 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.23 
 
 
316 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.65 
 
 
322 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.77 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.63 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.93 
 
 
321 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.69 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  35 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.28 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.28 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  25.48 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.89 
 
 
327 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  30.53 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.16 
 
 
385 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.11 
 
 
396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  32.69 
 
 
315 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  38.61 
 
 
321 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  31.08 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.65 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  34.45 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.63 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.17 
 
 
434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.1 
 
 
292 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  28.7 
 
 
332 aa  125  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  27.76 
 
 
318 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  33.21 
 
 
410 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.27 
 
 
408 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  32.05 
 
 
336 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.12 
 
 
312 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.73 
 
 
402 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  28.48 
 
 
317 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.94 
 
 
300 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>