More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0980 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  69.57 
 
 
207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  69.57 
 
 
207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  70.44 
 
 
205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  69.08 
 
 
211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  70.05 
 
 
207 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  68.78 
 
 
207 aa  280  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  68.12 
 
 
207 aa  276  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  67.8 
 
 
207 aa  275  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  65.37 
 
 
219 aa  274  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 
207 aa  274  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
224 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  62.38 
 
 
210 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  61.43 
 
 
210 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  58.5 
 
 
205 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 
207 aa  214  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
215 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
212 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
212 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
218 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
211 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
213 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
211 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
212 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 
211 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
211 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
211 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 
212 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
207 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
210 aa  185  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
212 aa  184  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
209 aa  180  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
212 aa  177  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  40.2 
 
 
212 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
209 aa  176  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  44.78 
 
 
203 aa  176  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
209 aa  176  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
208 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
211 aa  174  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
215 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
215 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
303 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
210 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1846  Uracil phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
208 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000894444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
209 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
207 aa  169  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 
209 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 
209 aa  168  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 
209 aa  168  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
208 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
209 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
210 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 
211 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
208 aa  165  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  42.25 
 
 
208 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  42.25 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
209 aa  164  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2743  uracil phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
208 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000380844  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2759  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2379  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  0.622917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2451  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00571838  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>