More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0829 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  97.14 
 
 
210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  71.5 
 
 
207 aa  291  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  69.76 
 
 
207 aa  286  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  69.57 
 
 
207 aa  284  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  72.68 
 
 
205 aa  281  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
219 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  63.9 
 
 
207 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 
207 aa  258  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
224 aa  254  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
211 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  62.38 
 
 
209 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  61.08 
 
 
205 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 
212 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  59.42 
 
 
207 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
213 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
212 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
218 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
212 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
217 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 
217 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
211 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
212 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
212 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
209 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
211 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
209 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
213 aa  188  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
212 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
207 aa  185  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
209 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
209 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
210 aa  181  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
209 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
209 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 
203 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
209 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
209 aa  177  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
209 aa  177  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
209 aa  177  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
207 aa  177  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
209 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
209 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
226 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
210 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
209 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
211 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1648  uracil phosphoribosyltransferase  45.59 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
211 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
208 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
216 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
216 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  42 
 
 
207 aa  169  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
209 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
208 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
211 aa  168  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4443  uracil phosphoribosyltransferase  41.29 
 
 
212 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
208 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
215 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
210 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
215 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0480  uracil phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
209 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000100882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>