More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  61.54 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 		 209 aa  262  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 		 209 aa  262  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 		 209 aa  258  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 		 208 aa  251  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  247  8e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  58.05 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 209 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 		 211 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 		 211 aa  242  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 209 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  55.67 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  55.67 
 
 		 370 aa  235  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 		 213 aa  234  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 		 303 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  54.68 
 
 		 208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  228  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 		 216 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 		 216 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 211 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>