More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0260 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  82.78 
 
 
209 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  79.33 
 
 
213 aa  348  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  74.52 
 
 
210 aa  333  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  71.77 
 
 
209 aa  327  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 
226 aa  325  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 
209 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  323  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  69.86 
 
 
209 aa  322  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 
209 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
209 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  69.86 
 
 
209 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 
209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  67.94 
 
 
209 aa  309  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  68.45 
 
 
207 aa  304  8.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  66.99 
 
 
209 aa  298  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
209 aa  298  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  66.99 
 
 
209 aa  298  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  66.18 
 
 
209 aa  288  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
209 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 
370 aa  285  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  63.03 
 
 
211 aa  281  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  280  9e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 
208 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  275  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  60.89 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  62.25 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 
211 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  271  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  271  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 
211 aa  269  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  269  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  58.45 
 
 
215 aa  268  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  58.94 
 
 
215 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
216 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 
211 aa  264  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
213 aa  264  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
216 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
209 aa  261  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
227 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
211 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
209 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 
210 aa  258  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
211 aa  257  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
210 aa  256  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
220 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  57.77 
 
 
303 aa  254  4e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
214 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
210 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
220 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
210 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
210 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
216 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 
213 aa  248  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
207 aa  248  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 
210 aa  248  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
213 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
216 aa  247  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
216 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
210 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
209 aa  246  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
216 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
216 aa  245  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 
218 aa  245  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
216 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
216 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
216 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>