More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1439 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  76.73 
 
 
209 aa  323  8.000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  74.26 
 
 
209 aa  321  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  72.28 
 
 
209 aa  317  9e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  72 
 
 
209 aa  314  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  71.5 
 
 
209 aa  313  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  70.3 
 
 
209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  72.55 
 
 
211 aa  311  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  70.3 
 
 
209 aa  310  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  71.29 
 
 
209 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  69.8 
 
 
209 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  71.78 
 
 
209 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  67.33 
 
 
209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  68.32 
 
 
209 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  71.08 
 
 
211 aa  299  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
209 aa  298  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
209 aa  298  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  67.33 
 
 
210 aa  295  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  68.81 
 
 
209 aa  295  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
226 aa  290  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 
209 aa  289  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  63.37 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
370 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  62.87 
 
 
213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  65.35 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  63.86 
 
 
208 aa  280  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  61.39 
 
 
209 aa  275  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  60.89 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
209 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  61.39 
 
 
208 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 
207 aa  266  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 
209 aa  258  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  58.91 
 
 
210 aa  255  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
227 aa  255  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
209 aa  254  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  59.61 
 
 
213 aa  254  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
207 aa  251  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
205 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 
209 aa  251  7e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
213 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
216 aa  250  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  250  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
207 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
209 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 
211 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
209 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
215 aa  248  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
209 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
220 aa  248  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
216 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 
210 aa  248  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
216 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
216 aa  247  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
218 aa  246  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
207 aa  246  2e-64  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
215 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
209 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  57.5 
 
 
208 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
211 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1341  uracil phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.281958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2693  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
208 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 
208 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  55 
 
 
210 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1352  uracil phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
208 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3121  uracil phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
208 aa  242  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1235  uracil phosphoribosyltransferase  56.5 
 
 
208 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0527635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
214 aa  241  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
214 aa  241  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>