More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4570 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  89.27 
 
 		 227 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  68.63 
 
 		 211 aa  308  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 209 aa  287  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 209 aa  287  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 208 aa  285  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 		 208 aa  284  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 211 aa  284  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 209 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 213 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 		 216 aa  280  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 211 aa  278  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  60.78 
 
 		 210 aa  277  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 209 aa  277  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 		 216 aa  275  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  62.25 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 220 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 211 aa  271  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  60.78 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 		 210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 		 209 aa  267  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  60.78 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  59.8 
 
 		 209 aa  265  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 		 209 aa  265  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  59.8 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  57.84 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 		 209 aa  264  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 		 209 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 		 209 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 210 aa  262  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  57.84 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 		 209 aa  257  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 		 214 aa  257  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 209 aa  257  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  55.12 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  58.13 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3259  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  58.05 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 		 203 aa  251  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 		 213 aa  251  6e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 209 aa  247  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  56.37 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 209 aa  244  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 		 370 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  55.39 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  53.92 
 
 		 209 aa  234  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  55.39 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  53.2 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0699433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 		 208 aa  227  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>