More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3518 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  90.43 
 
 
209 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  89.95 
 
 
209 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  87.92 
 
 
215 aa  387  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  83.73 
 
 
209 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  82.78 
 
 
209 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  80.38 
 
 
209 aa  361  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  79.61 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  80.1 
 
 
213 aa  356  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  76.08 
 
 
209 aa  341  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  76.08 
 
 
209 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  76.08 
 
 
209 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  73.3 
 
 
214 aa  329  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  70.87 
 
 
211 aa  311  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3259  uracil phosphoribosyltransferase  67.96 
 
 
211 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  67.31 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
214 aa  299  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
214 aa  299  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  66.02 
 
 
210 aa  297  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  66.02 
 
 
210 aa  293  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  64.73 
 
 
211 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
226 aa  292  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
209 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  288  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
209 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 
220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  65.69 
 
 
210 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 
216 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 
213 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  64.22 
 
 
220 aa  284  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  284  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  65.05 
 
 
210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 
216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  65.05 
 
 
210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 
216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  63.03 
 
 
211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 
216 aa  280  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  279  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 
227 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  63.11 
 
 
210 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 
213 aa  278  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 
208 aa  278  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  62.25 
 
 
208 aa  277  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 
209 aa  277  9e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 
210 aa  276  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 
208 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  61.61 
 
 
211 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  275  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 
205 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  61.72 
 
 
209 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 
211 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 
209 aa  270  9e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  268  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
209 aa  267  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 
207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
209 aa  265  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 
210 aa  261  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  261  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  258  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
209 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
211 aa  255  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
209 aa  254  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
203 aa  254  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
209 aa  251  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
370 aa  249  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 
208 aa  249  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
209 aa  249  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  60.58 
 
 
218 aa  247  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 
214 aa  244  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
207 aa  237  6.999999999999999e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  53.43 
 
 
211 aa  236  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
216 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
216 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  52.71 
 
 
207 aa  228  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
209 aa  226  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
209 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
216 aa  224  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 
213 aa  224  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  224  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>