More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2462 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  99.04 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  75.12 
 
 		 209 aa  337  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  73.21 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  73.68 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  72.73 
 
 		 209 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 		 209 aa  328  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  71.77 
 
 		 209 aa  323  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  73.21 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  73.21 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  74.13 
 
 		 213 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  74.88 
 
 		 210 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 		 209 aa  318  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  69.86 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  72 
 
 		 203 aa  314  6e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 		 209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 		 209 aa  311  4.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 		 209 aa  310  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 		 209 aa  309  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 		 209 aa  308  2.9999999999999997e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 		 209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 		 209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  66.82 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  67.98 
 
 		 370 aa  298  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 		 209 aa  298  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  67 
 
 		 207 aa  293  9e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 		 208 aa  293  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  67.46 
 
 		 209 aa  293  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 		 209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 		 209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 		 209 aa  270  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 		 213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  59.11 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  58.94 
 
 		 215 aa  267  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 		 209 aa  264  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 		 209 aa  262  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  58.13 
 
 		 211 aa  261  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 210 aa  260  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 220 aa  259  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 		 210 aa  259  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 208 aa  257  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  58.13 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 		 209 aa  256  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 		 205 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  58.45 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 303 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 		 209 aa  248  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>