More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1697 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  99.52 
 
 
209 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  92.27 
 
 
215 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  89.95 
 
 
209 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  85.65 
 
 
209 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  84.21 
 
 
209 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  85.65 
 
 
209 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  81.64 
 
 
215 aa  361  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  81.64 
 
 
213 aa  360  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 
209 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 
209 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 
209 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  71.5 
 
 
214 aa  327  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 
211 aa  324  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  70.19 
 
 
209 aa  314  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  69.9 
 
 
210 aa  309  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3259  uracil phosphoribosyltransferase  68.25 
 
 
211 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  69.08 
 
 
211 aa  304  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
226 aa  300  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 
216 aa  299  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  65.87 
 
 
216 aa  299  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 
216 aa  298  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  67.65 
 
 
210 aa  298  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 
220 aa  297  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
209 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
209 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
211 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  66.5 
 
 
220 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 
211 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
213 aa  291  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  67.96 
 
 
216 aa  286  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  64.11 
 
 
209 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 
210 aa  286  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  65.07 
 
 
209 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 
227 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 
213 aa  282  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 
205 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  61.14 
 
 
211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 
208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  61.72 
 
 
210 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  63.11 
 
 
208 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
208 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 
210 aa  279  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  62.56 
 
 
211 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
210 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
210 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  279  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 
209 aa  278  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 
210 aa  276  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  275  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  275  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  61.24 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 
209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 
209 aa  272  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  271  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
209 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
218 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  264  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  259  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 
209 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  61.72 
 
 
218 aa  255  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
208 aa  255  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 
211 aa  254  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 
207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  54.41 
 
 
370 aa  250  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  53.96 
 
 
203 aa  249  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
209 aa  249  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
208 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 
214 aa  238  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  53.92 
 
 
207 aa  234  7e-61  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
216 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
216 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
216 aa  228  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
209 aa  228  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
209 aa  228  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
213 aa  228  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
216 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
216 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>