More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0471 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
211 aa  410  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  80.09 
 
 
211 aa  314  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  74.88 
 
 
211 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  75 
 
 
213 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  78.37 
 
 
212 aa  309  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  76.3 
 
 
212 aa  308  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 
212 aa  300  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  74.06 
 
 
212 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  72.38 
 
 
217 aa  298  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  75.36 
 
 
211 aa  295  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  71.09 
 
 
212 aa  293  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  71.7 
 
 
215 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  69.81 
 
 
212 aa  288  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  70.83 
 
 
217 aa  286  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  67.62 
 
 
211 aa  283  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  67.14 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
218 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  65.57 
 
 
213 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  64.93 
 
 
212 aa  272  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
209 aa  228  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  56.87 
 
 
207 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
219 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
226 aa  218  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  217  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
220 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  215  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  215  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
209 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
220 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  214  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
207 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
207 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
209 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
207 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
203 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
208 aa  208  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
209 aa  208  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
209 aa  208  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 
209 aa  208  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
211 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
209 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 
209 aa  207  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
209 aa  207  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
211 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
212 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
210 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
210 aa  205  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
213 aa  205  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
370 aa  204  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
207 aa  204  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
210 aa  203  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
303 aa  202  2e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
209 aa  201  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
210 aa  201  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
208 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
213 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
211 aa  201  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5295  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
212 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
215 aa  198  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
215 aa  198  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
209 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
209 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>