More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3539 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  86.79 
 
 
212 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  79.25 
 
 
213 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  80.66 
 
 
215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  77.31 
 
 
217 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  74.52 
 
 
217 aa  307  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  71.23 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  73.08 
 
 
211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  78.37 
 
 
211 aa  300  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  69.67 
 
 
211 aa  299  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  69.19 
 
 
211 aa  296  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  75 
 
 
211 aa  292  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  71.63 
 
 
212 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  64.62 
 
 
212 aa  275  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 
212 aa  274  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  72.12 
 
 
212 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  64.32 
 
 
213 aa  269  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  63.98 
 
 
218 aa  266  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  68.27 
 
 
211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
207 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
219 aa  227  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 
207 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
226 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
210 aa  214  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
207 aa  214  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  211  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
209 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
216 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
370 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
209 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
220 aa  208  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
216 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
211 aa  208  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
209 aa  208  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
216 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
209 aa  207  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
220 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
211 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
209 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
207 aa  205  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
209 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
211 aa  205  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
207 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
224 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
207 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
207 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
210 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
210 aa  203  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
210 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
209 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
209 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
203 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
209 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
209 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
209 aa  202  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
209 aa  202  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
208 aa  201  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
209 aa  201  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
211 aa  201  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
207 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
210 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
211 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
208 aa  199  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
210 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
210 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
211 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
211 aa  198  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
209 aa  197  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
210 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
208 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
208 aa  194  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
205 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
207 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 
208 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
205 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
207 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
209 aa  191  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>