More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  73.58 
 
 
213 aa  318  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  71.23 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  71.23 
 
 
212 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  69.81 
 
 
211 aa  295  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
217 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
215 aa  288  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  68.87 
 
 
212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  71.7 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
211 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  65.4 
 
 
211 aa  279  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  67.92 
 
 
212 aa  276  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  69.81 
 
 
211 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  65.57 
 
 
212 aa  276  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  65.74 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  60.09 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  58.49 
 
 
212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  62.26 
 
 
211 aa  248  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
209 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  210  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  51.47 
 
 
203 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
209 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  207  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
209 aa  205  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
209 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
207 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 
209 aa  203  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
208 aa  201  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
207 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
209 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
210 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 
209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 
209 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
211 aa  198  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
370 aa  198  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
207 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
209 aa  194  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
224 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
211 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
208 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
210 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
213 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
213 aa  192  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
219 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
211 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
214 aa  191  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
207 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2095  uracil phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
209 aa  191  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
207 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
210 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
209 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 
208 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
207 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
212 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
210 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
209 aa  189  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0480  uracil phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000100882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
209 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4728  uracil phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
212 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202262  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1448  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
208 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
210 aa  188  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5295  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
212 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0946  uracil phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
212 aa  187  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0868465  normal  0.525652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
212 aa  187  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
209 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
209 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
207 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
209 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1979  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
212 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 
208 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
209 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
220 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
209 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2490  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
208 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>