More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1350 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  76.81 
 
 		 207 aa  324  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  78.54 
 
 		 207 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  68.29 
 
 		 207 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  68.6 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  65.37 
 
 		 207 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  65.37 
 
 		 209 aa  274  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  65.37 
 
 		 207 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  65.37 
 
 		 207 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 211 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  65.67 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  63.77 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  63 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 		 212 aa  227  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  51.64 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  51.42 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 212 aa  214  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 		 211 aa  205  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  47.52 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 212 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  46.57 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 208 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  45.59 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  47.26 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  45.59 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  43.13 
 
 		 370 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  45.59 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 		 208 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>