More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  88.78 
 
 		 207 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  78.54 
 
 		 219 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  70.24 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  69.76 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  69.27 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 		 209 aa  274  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  64.18 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  65.5 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 211 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  49.26 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  47.52 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 		 209 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  49.26 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 		 303 aa  188  5e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 226 aa  187  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1648  uracil phosphoribosyltransferase  48.51 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  45.32 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>