More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2194 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
212 aa  433  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 
208 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  73.43 
 
 
208 aa  328  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  73.43 
 
 
209 aa  328  4e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
208 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  66.18 
 
 
208 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
226 aa  231  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
209 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
209 aa  231  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
209 aa  230  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
209 aa  230  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
207 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
210 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
209 aa  229  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  227  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
213 aa  227  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
209 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
211 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
203 aa  225  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
209 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  49.5 
 
 
207 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
209 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
208 aa  221  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
207 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
208 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
210 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
209 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
210 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
370 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  215  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
211 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2169  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.215799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
215 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
209 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
216 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
210 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
210 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
209 aa  210  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
208 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 
214 aa  210  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
216 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
211 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
209 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
220 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1448  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
208 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
209 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
208 aa  208  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
212 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
210 aa  207  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
208 aa  207  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
209 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
212 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
212 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5295  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
212 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
208 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 
215 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
208 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
214 aa  204  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
214 aa  204  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
227 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
209 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0746  uracil phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
212 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
213 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
207 aa  202  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0787  uracil phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
212 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.785203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0947  uracil phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
208 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0774  uracil phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
212 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>