More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0581 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  91.35 
 
 		 208 aa  387  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  72.77 
 
 		 206 aa  311  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2169  uracil phosphoribosyltransferase  71.36 
 
 		 209 aa  308  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.215799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  64.42 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  62.02 
 
 		 209 aa  248  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  58.05 
 
 		 207 aa  245  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  59.13 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 209 aa  234  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  57.77 
 
 		 213 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  228  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  228  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 		 370 aa  227  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 		 216 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  56 
 
 		 211 aa  221  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  53 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  53.2 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 209 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  53.2 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  53.43 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  52.88 
 
 		 209 aa  214  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 207 aa  214  8e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  53 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 208 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2576  uracil phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 		 208 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02040  uracil phosphoribosyltransferase, putative  50 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0946  uracil phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0868465  normal  0.525652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2096  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2743  uracil phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000380844  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  49.25 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  49.25 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>