More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4836 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
224 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  90.34 
 
 
207 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  77.78 
 
 
207 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  77.78 
 
 
207 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  74.88 
 
 
207 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  77.07 
 
 
205 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  68.75 
 
 
211 aa  294  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 
219 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 
207 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 
209 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 
207 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 
207 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
210 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
210 aa  251  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  60.5 
 
 
205 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
212 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 
207 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 
218 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
211 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
212 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
212 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
217 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
207 aa  201  5e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
211 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  45 
 
 
207 aa  194  9e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
212 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  50.72 
 
 
212 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
209 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
209 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  45.32 
 
 
209 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
207 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
209 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
209 aa  191  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
210 aa  191  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
210 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
303 aa  189  4e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
208 aa  188  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
209 aa  188  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
211 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
209 aa  187  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
203 aa  187  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
213 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
211 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
207 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
213 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
208 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
210 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
216 aa  184  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
212 aa  184  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
216 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
212 aa  184  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
211 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  46.57 
 
 
370 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 
209 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
211 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
209 aa  181  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1648  uracil phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
210 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
209 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
209 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
210 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
210 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
215 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
215 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2095  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
209 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 
209 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
212 aa  178  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  43.63 
 
 
209 aa  178  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
209 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3186  uracil phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
208 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  43.13 
 
 
213 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
208 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>