More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0079 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  81.22 
 
 		 213 aa  353  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  68.12 
 
 		 212 aa  298  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 211 aa  289  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  64.76 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  66.82 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  64.76 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 		 212 aa  274  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  68.25 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  62.74 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  68.4 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  65.09 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 		 217 aa  268  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  64.15 
 
 		 213 aa  268  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  63.21 
 
 		 215 aa  264  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  62.91 
 
 		 217 aa  264  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  64.93 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  60.85 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  58.49 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  51.71 
 
 		 226 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 211 aa  206  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  51.71 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 203 aa  201  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 		 210 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 370 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>