More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4832 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
217 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  77.31 
 
 
212 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  75.35 
 
 
213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  74.07 
 
 
215 aa  307  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  73.15 
 
 
212 aa  305  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  68.2 
 
 
211 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 
217 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  67.28 
 
 
211 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
211 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  70.83 
 
 
211 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
211 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  65.74 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
212 aa  269  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
212 aa  268  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  65.58 
 
 
212 aa  268  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  63.3 
 
 
218 aa  263  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 
213 aa  258  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  64.81 
 
 
212 aa  258  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 
211 aa  245  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 
207 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
209 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
207 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
209 aa  209  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
209 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
207 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
211 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
203 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
219 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
207 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 
226 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  45.97 
 
 
209 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
211 aa  205  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  53.08 
 
 
205 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
207 aa  205  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
211 aa  204  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
209 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
210 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
224 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
207 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  46.26 
 
 
210 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
208 aa  201  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
209 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
210 aa  201  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
209 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
209 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  46.26 
 
 
209 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
208 aa  197  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  49.77 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 
370 aa  194  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 
209 aa  195  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
209 aa  194  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
210 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
209 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
211 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
209 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
209 aa  192  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
208 aa  192  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
213 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 
212 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
209 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  49.3 
 
 
216 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
207 aa  190  1e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
220 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0480  uracil phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
209 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000100882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
216 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
212 aa  188  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
213 aa  188  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
214 aa  188  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0086  uracil phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
209 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.91121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
209 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
227 aa  187  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 
210 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>