More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1785 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  72.95 
 
 		 207 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  70.53 
 
 		 207 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  68.75 
 
 		 224 aa  294  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  71.01 
 
 		 207 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  71.01 
 
 		 207 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  71.92 
 
 		 205 aa  290  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  69.08 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 		 207 aa  277  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  64.88 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 		 207 aa  261  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  56 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  54.03 
 
 		 218 aa  204  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  49.5 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  46.83 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  43.63 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 208 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  46.57 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2576  uracil phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1514  uracil phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000447278  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2693  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1130  uracil phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 		 303 aa  165  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  41.04 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>