More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0689 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5922  uracil phosphoribosyltransferase  78.57 
 
 		 207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13338  uracil phosphoribosyltransferase  57.62 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0829  uracil phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0684126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0773  uracil phosphoribosyltransferase  56.13 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.236088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4836  uracil phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 224 aa  227  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1600  uracil phosphoribosyltransferase  59.05 
 
 		 207 aa  227  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398813  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4386  uracil phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1785  uracil phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6429  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1267  uracil phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 207 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1257  uracil phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 207 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1240  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  54.72 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1350  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0980  uracil phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  51.17 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0744  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  54.72 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 209 aa  188  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1648  uracil phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  41.43 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 		 370 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 		 303 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1755  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1648  uracil phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1715  uracil phosphoribosyltransferase  46.76 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0996  uracil phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.688134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>