More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1715 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1715  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0591  uracil phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 
216 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2191  uracil phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 
216 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3111  uracil phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 
216 aa  284  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.433103  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0992  uracil phosphoribosyltransferase  60.65 
 
 
216 aa  281  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0752751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4337  uracil phosphoribosyltransferase  60.65 
 
 
216 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0913  uracil phosphoribosyltransferase  57.87 
 
 
216 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0887  uracil phosphoribosyltransferase  57.87 
 
 
216 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32758  predicted protein  55.24 
 
 
212 aa  250  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278364  normal  0.120545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
211 aa  188  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 
209 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  44.88 
 
 
209 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
207 aa  185  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
209 aa  184  9e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
207 aa  182  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
209 aa  181  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
211 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
370 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
207 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
210 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
209 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
209 aa  177  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 
209 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
210 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2169  uracil phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
209 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.215799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
209 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
208 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1648  uracil phosphoribosyltransferase  48.53 
 
 
212 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
209 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
209 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4070  uracil phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
208 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
208 aa  174  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
209 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
209 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  46.76 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
210 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 
209 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2096  uracil phosphoribosyltransferase  43.66 
 
 
208 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  43.13 
 
 
209 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
210 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  45.07 
 
 
211 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2743  uracil phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
208 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000380844  hitchhiker  0.000408607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2759  uracil phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
209 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2379  uracil phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  0.622917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2451  uracil phosphoribosyltransferase  42.4 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00571838  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  168  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
218 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1846  Uracil phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
208 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000894444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
208 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
207 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  45.07 
 
 
211 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
208 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1130  uracil phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
208 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
210 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
208 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1514  uracil phosphoribosyltransferase  41.31 
 
 
208 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000447278  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1967  uracil phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
215 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
227 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2263  uracil phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
215 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.141851  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2576  uracil phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
208 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02630  uracil phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
209 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
208 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0996  uracil phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.688134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3186  uracil phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>