More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0115 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.28 
 
 		 518 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  68.09 
 
 		 517 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 516 aa  1050    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.55 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  52.31 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.42 
 
 		 534 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  50.41 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.81 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.63 
 
 		 541 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 		 538 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.58 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.44 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.42 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  47.33 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.74 
 
 		 510 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.78 
 
 		 522 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  38.06 
 
 		 497 aa  277  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.14 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.65 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.16 
 
 		 494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.43 
 
 		 494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.43 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 494 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  36.82 
 
 		 485 aa  269  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 491 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.26 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 		 494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.71 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 		 494 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 		 494 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 		 494 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.01 
 
 		 499 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  34.91 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 494 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 		 487 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  37.77 
 
 		 499 aa  262  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  35.78 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  35.97 
 
 		 488 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 		 483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1516  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.91 
 
 		 498 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.394302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.46 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.46 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  34.67 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 487 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 496 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 496 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.18 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.13 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.06 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 		 493 aa  258  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  34.65 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  34.65 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  34.65 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  34.65 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  34.65 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.48 
 
 		 488 aa  257  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.13 
 
 		 482 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.13 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  34.63 
 
 		 483 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 484 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  37.04 
 
 		 485 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  35.76 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.07 
 
 		 493 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.13 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.22 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.99 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.34 
 
 		 482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.97 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0917  succinate-semialdehyde dehydrogenase(NADP+)  34.25 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0952365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>