291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1006 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  36.93 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  37.42 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  37.42 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  39.19 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  38.16 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  32.78 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  35.2 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.72 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  35.02 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.99 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  29.62 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  27.36 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  32.12 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  28.71 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  30.82 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  32.35 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  31.8 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  33.56 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.87 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  30.9 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  32.21 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  27.67 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  31.15 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  29.61 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  26.1 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  26.56 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  28.99 
 
 		 363 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.84 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  25.99 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  26.58 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  27.4 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  24.15 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  27.61 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  26.13 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  28.86 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  27.96 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  27.1 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  24.91 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  29.89 
 
 		 422 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  25.74 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  28.52 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  24.19 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.62 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.14 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  26.47 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  25.57 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  28.52 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  24.49 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.73 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  27.78 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  25.08 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  28.79 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  28.44 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0058  C32 tRNA thiolase  26.75 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  28.77 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  33.53 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  27.85 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  24.16 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  26.79 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  26.79 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  26.25 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  25.12 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  28.04 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  25.68 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  26.37 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  26.57 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  29.23 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  29 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.79 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  26.57 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  25.59 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  27.51 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0182  PP-loop domain-containing protein  27.37 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  29.59 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.21 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  29.3 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  28.91 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.28 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.28 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.28 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  29.11 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  30.36 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  24.43 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  30 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  29.13 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  26.17 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  26.17 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  28.44 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  27.96 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>