66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0423 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  100 
 
 		 555 aa  1129    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  47.13 
 
 		 552 aa  528  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  47.31 
 
 		 552 aa  531  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  48.41 
 
 		 562 aa  507  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  28.28 
 
 		 782 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  30.39 
 
 		 679 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.91 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  29.31 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  32.1 
 
 		 578 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.57 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  29.57 
 
 		 579 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  29.79 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  30.79 
 
 		 1020 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  27.66 
 
 		 824 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  29.63 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  27.95 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  24.84 
 
 		 666 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  23.39 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26.42 
 
 		 734 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  27.53 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  24.1 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.53 
 
 		 729 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  25.17 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  29.1 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  28.3 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  22.98 
 
 		 729 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  29.57 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.79 
 
 		 733 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  22.49 
 
 		 708 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  28.68 
 
 		 723 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  22.49 
 
 		 708 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  22.49 
 
 		 708 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.17 
 
 		 718 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  23.62 
 
 		 694 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  24.53 
 
 		 699 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  23.47 
 
 		 716 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  25 
 
 		 684 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  24.53 
 
 		 718 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  30 
 
 		 701 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.97 
 
 		 700 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  24.68 
 
 		 728 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  21.56 
 
 		 768 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  26.55 
 
 		 774 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  27.5 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  22.17 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.59 
 
 		 726 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  26.29 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 722 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  25.76 
 
 		 743 aa  47.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  27.54 
 
 		 706 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3595  hypothetical protein  21.54 
 
 		 731 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0030344  hitchhiker  0.000112547 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.27 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  24 
 
 		 723 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  29.9 
 
 		 707 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  24 
 
 		 736 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  21.88 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  27.63 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  22.84 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  21.49 
 
 		 892 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.36 
 
 		 699 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  27.01 
 
 		 724 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  21.11 
 
 		 724 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.07 
 
 		 533 aa  43.9  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  29 
 
 		 730 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29 
 
 		 734 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>