More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0188 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  59.14 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  59.14 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  49.64 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  46.27 
 
 
265 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.61 
 
 
274 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.21 
 
 
324 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  40.34 
 
 
363 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  37.55 
 
 
417 aa  161  9e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.56 
 
 
430 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  54.03 
 
 
404 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  34.82 
 
 
412 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  57.5 
 
 
377 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  37.08 
 
 
307 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.48 
 
 
419 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  33.74 
 
 
283 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  56.91 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  51.97 
 
 
374 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.97 
 
 
377 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.9 
 
 
376 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.61 
 
 
411 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  46.67 
 
 
238 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  34.98 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  34.3 
 
 
320 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  52.42 
 
 
400 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  48.82 
 
 
372 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.71 
 
 
284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  53.6 
 
 
375 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  50 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  49.22 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  52.42 
 
 
404 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  48.76 
 
 
347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  50 
 
 
490 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  53.28 
 
 
529 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  48.39 
 
 
346 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  31.27 
 
 
582 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  48 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  48 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  49.18 
 
 
308 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  52.1 
 
 
527 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  39.36 
 
 
471 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  51.28 
 
 
524 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  50.77 
 
 
414 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  48.82 
 
 
375 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  43.92 
 
 
216 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  50 
 
 
223 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.32 
 
 
379 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  39.26 
 
 
247 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.78 
 
 
523 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  50 
 
 
402 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.62 
 
 
472 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.83 
 
 
471 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  31.35 
 
 
402 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  46.34 
 
 
274 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  48.28 
 
 
464 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.2 
 
 
441 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.58 
 
 
431 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  50.41 
 
 
301 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  49.14 
 
 
457 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.79 
 
 
374 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.03 
 
 
367 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  50 
 
 
464 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  49.57 
 
 
465 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  51.26 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  50.86 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  47.97 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  42.76 
 
 
475 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  48.31 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  46.03 
 
 
444 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  50.46 
 
 
687 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.79 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.88 
 
 
229 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.6 
 
 
309 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  48.31 
 
 
282 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.36 
 
 
243 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  46.34 
 
 
300 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  46.15 
 
 
460 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  31.08 
 
 
314 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  49.14 
 
 
465 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.28 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.28 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  47.93 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  46.27 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  46.27 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  47.41 
 
 
454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  47.37 
 
 
468 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.3 
 
 
430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.56 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50.41 
 
 
482 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  47.41 
 
 
454 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.28 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.56 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  47.66 
 
 
824 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  47.37 
 
 
447 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.15 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  43.7 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  42.4 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  45.3 
 
 
446 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>