86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3118 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 605 aa  1192    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.85 
 
 		 783 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.85 
 
 		 783 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  39.32 
 
 		 610 aa  293  5e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  33.61 
 
 		 785 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  32.09 
 
 		 785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  37.65 
 
 		 781 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.16 
 
 		 772 aa  273  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 		 772 aa  273  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 		 773 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  31.75 
 
 		 777 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.88 
 
 		 793 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.41 
 
 		 786 aa  257  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  36.77 
 
 		 743 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  32.72 
 
 		 802 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 		 773 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  35.03 
 
 		 778 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  34.16 
 
 		 773 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 781 aa  238  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 788 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  31.87 
 
 		 759 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 759 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  35.28 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 		 756 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  29.84 
 
 		 773 aa  204  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.05 
 
 		 766 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.35 
 
 		 769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  42.86 
 
 		 749 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  34.43 
 
 		 517 aa  191  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.67 
 
 		 757 aa  190  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  32.97 
 
 		 519 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.53 
 
 		 562 aa  156  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  33.65 
 
 		 842 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  32.42 
 
 		 852 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  34.47 
 
 		 831 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  34.47 
 
 		 805 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.15 
 
 		 612 aa  143  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 		 637 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 		 607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34.97 
 
 		 624 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  32.78 
 
 		 705 aa  140  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.32 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33.02 
 
 		 633 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 		 631 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  33.02 
 
 		 633 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  33.02 
 
 		 633 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 913 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 		 650 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  33.86 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  35.69 
 
 		 638 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  28.15 
 
 		 647 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.14 
 
 		 644 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 		 570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 		 570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 		 570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  35.11 
 
 		 570 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.39 
 
 		 689 aa  125  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  31.37 
 
 		 636 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.18 
 
 		 618 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.87 
 
 		 624 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  35.06 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 		 624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 		 1006 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 647 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  30.63 
 
 		 612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.45 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 		 677 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  30.63 
 
 		 612 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  32.3 
 
 		 637 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.33 
 
 		 645 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  41.2 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.27 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.27 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.27 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  32.48 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 571 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  31.6 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  27.71 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.99 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  32.09 
 
 		 617 aa  47.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  25.17 
 
 		 612 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  22.27 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>