More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2957 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  73.79 
 
 
143 aa  222  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  62.41 
 
 
144 aa  186  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  59.57 
 
 
144 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  58.16 
 
 
139 aa  175  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  55.41 
 
 
148 aa  169  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  52.26 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  52.7 
 
 
150 aa  147  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  46.26 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  47.95 
 
 
158 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  47.95 
 
 
151 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  47.95 
 
 
151 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
145 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  45.52 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  45.58 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
146 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
146 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
147 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 
148 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 
145 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 
151 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
142 aa  104  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 
146 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
141 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
151 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
163 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
162 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
189 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  39.86 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  42.45 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.94 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
153 aa  94.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  38.67 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
189 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
189 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  49.02 
 
 
231 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  49.02 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  43.88 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
149 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  42.74 
 
 
195 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
176 aa  90.5  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  44.86 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  43.24 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.03 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
230 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
176 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
185 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
185 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  51.09 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 
144 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
177 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.89 
 
 
146 aa  87  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  37.41 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
147 aa  87  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.59 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>