119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2931 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  410  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  70.16 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  52.78 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  51.37 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  47.83 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  40.86 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  53.57 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  40.86 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  40.86 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  47.02 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  42.44 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  45.2 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  43.32 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  41.97 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  46.43 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  42.77 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  40.53 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  44.57 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  40.24 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  38.17 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  39.36 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  37.43 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  42.47 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  41.71 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  36.13 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  40.34 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  40.11 
 
 		 179 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  38.96 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  42 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  40.56 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  34.56 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  34.56 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  41.85 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  35.29 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  34.9 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  35.76 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  28.72 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  29.53 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  33.8 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  33.68 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  33.16 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  30.39 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  34.1 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  37.68 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  28.12 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 279 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.95 
 
 		 554 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  33.57 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.45 
 
 		 365 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.45 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.22 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.9 
 
 		 356 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.55 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 523 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  26.9 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3383  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 519 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  28.73 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  31.29 
 
 		 362 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  34.24 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  30.94 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 511 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  31.47 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  32 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 293 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  31.91 
 
 		 386 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  31.51 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.97 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  31.4 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  28.86 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 579 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  33.61 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.61 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  33.61 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.61 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  29.5 
 
 		 486 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  28.77 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  29.35 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.85 
 
 		 389 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3327  rhomboid family membrane protein  31.58 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0229306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4052  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0629739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>