More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2825 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  57.38 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  59.4 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  47.67 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  24.6 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6757  transcriptional regulator, LysR family  23.91 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4733  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  26.91 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1833  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0053  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  30.53 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0270  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  30.27 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4831  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  28.1 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4473  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0050  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7214  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3644  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2079  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843078  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2178  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3637  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360851 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8398  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2687  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6666  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1195  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279757  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2370  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0480088  normal  0.369586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0478  transcriptional regulator HdfR  31.05 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.76751  normal  0.0689063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3382  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4064  transcriptional regulator HdfR  31.05 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00823  leucine transcriptional activator  27.27 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1918  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4319  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0798  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2195  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0150  transcriptional regulator HdfR  31.05 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1252  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2061  leucine transcriptional activator  27.24 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  31.89 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25320  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  29.64 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45050  Transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1309  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1219  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4058  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001651  transcriptional regulator LysR family  28.04 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0933  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  33.17 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2328  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.475016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  27.03 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5373  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0478258  normal  0.118386 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6471  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>