More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1833 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1833  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3382  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3202  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  30.32 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0879  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3416  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3085  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.21 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4059  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  31.32 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1366  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.320453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4206  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6114  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2034  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1309  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4550  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.597489  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1719  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0165  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.93 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6369  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0341  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0795  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3210  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3631  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.489296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4023  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.34925  normal  0.83755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7661  transcriptional regulator LysR family  29.18 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2084  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.0802538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  27.01 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  27.22 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  27.74 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  26.97 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3816  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0798  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  29.23 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  29.23 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  29.23 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2501  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2590  nitrogen assimilation transcriptional regulator  31.53 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  29.23 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  29.23 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  29.23 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6676  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  28.87 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  28.87 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0663  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.650838 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1431  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1501  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.25 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2564  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.71 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000767636  normal  0.0977076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>