110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3650 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  79.38 
 
 		 161 aa  267  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  78.12 
 
 		 161 aa  265  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  75.62 
 
 		 161 aa  264  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  78.26 
 
 		 161 aa  263  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  75.62 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  70.81 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  73.75 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  73.75 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  70.19 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  51.55 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  52.17 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  52.17 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  50.31 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  51.88 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  50.93 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  50.93 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  46.88 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  53.79 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  41.88 
 
 		 164 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  39.62 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  38.99 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  38.36 
 
 		 161 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  39.07 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  38.36 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  39.07 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  38.36 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  38.36 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  37.74 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  37.34 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  40.6 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  42.11 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  34.5 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  36.6 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  36.6 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  35.62 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  39.69 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  34.16 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  31.58 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  33.12 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  32.93 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  36.71 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  33.53 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  41.44 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  32.34 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  29.41 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  35.38 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  31.85 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  33.33 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  32.1 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  29.24 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  28.9 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  29.07 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  28.95 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  28.81 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  33.13 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  27.59 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  28 
 
 		 192 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  28.96 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  27.84 
 
 		 181 aa  84  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  28.42 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  28.49 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  26.55 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  26.82 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  28.12 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  30.86 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  29.25 
 
 		 194 aa  80.5  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  30.86 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  26.7 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  26.7 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.5 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  25.41 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.01 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  25.62 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.62 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  26.25 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  28.12 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  28.12 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  25 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  30.06 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  27.16 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.7 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  29.27 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  25 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  25 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  30.67 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  25.9 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  24.38 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  25.93 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  25.93 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  26.72 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  24.41 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  22.83 
 
 		 702 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  24.59 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>