231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0952 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  58.11 
 
 		 102 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  44.05 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 418 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  42.25 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  40 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  42.47 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  41.33 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  38.96 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  34.78 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  42.03 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  36.59 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  32.38 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  37.14 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  35 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  34.85 
 
 		 106 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  40.3 
 
 		 107 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  37.14 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  35.62 
 
 		 109 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  35.53 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  31.3 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 108 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  32.43 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  37.97 
 
 		 359 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  35.56 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  30.59 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  33.77 
 
 		 103 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1769  c553-type monoheme cytochrome c  23.43 
 
 		 432 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  38.57 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  39.13 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  38.27 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  30.88 
 
 		 108 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  34.85 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  36.36 
 
 		 100 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  38.89 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  37.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 101 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  36.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  39.19 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0669  hypothetical protein  32.86 
 
 		 157 aa  48.9  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0140591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  34.62 
 
 		 112 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0904  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 120 aa  48.5  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  36.92 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  32.88 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  33.78 
 
 		 129 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  32.88 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  36.92 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  35.29 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  39.68 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  35.35 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  31.65 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  38.81 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 102 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  31.17 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  32.47 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  38.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>