More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0321 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  38.91 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  35.41 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  35.18 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  35.18 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  33.08 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  32.95 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  32.16 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  32.55 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  33.73 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.59 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  29.69 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  32.18 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  29.92 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.7 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  30.98 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  32.8 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  33.07 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  33.07 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  33.07 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  33.07 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  33.07 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  31.13 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  32.55 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.59 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.59 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.2 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  29.13 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  33.5 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  31.1 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  31.1 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  31.1 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  32.05 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.07 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  32.42 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.07 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  32.16 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  30.35 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  31.27 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  31.09 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.81 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  30.65 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  30.92 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  30.8 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  30.71 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  30.71 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  30.47 
 
 		 278 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  30.23 
 
 		 462 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  30.31 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  32.3 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  31.66 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  32.42 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  31.54 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  31.06 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  30.15 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  30.65 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.05 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  34.23 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.12 
 
 		 464 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  30.89 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  31.15 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.05 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  29.92 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.77 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  29.46 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  32.42 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  30.68 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  31.91 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  31.1 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  28.9 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  29.39 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  30.95 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  31.92 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  28.63 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  30.62 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  30.2 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  31.01 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  30.23 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  28.96 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  28.96 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  30.62 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  30.23 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>