More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2596 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  68.27 
 
 		 276 aa  338  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  63.71 
 
 		 265 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  68.1 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  64.44 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  61 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  60.64 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  55.51 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  58.87 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  56.31 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  51.19 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 283 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  52.94 
 
 		 254 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  44.09 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.87 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 267 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  42.23 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  39.09 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  38.52 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  38.21 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  37.5 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  38.31 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  38.43 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  38 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  38 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  38 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  38 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  38 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  37.85 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  34.63 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  37.4 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  34.24 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  34.66 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  34.24 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  34.02 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.65 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.92 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  38.08 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  38.08 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 277 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  39.33 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  33.07 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>