More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2084 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  46.23 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.64 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  47.64 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  45.68 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  44.57 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  44.69 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  40.81 
 
 		 267 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  43.54 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  39.58 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 156 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.44 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  47.3 
 
 		 916 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.69 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.54 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 904 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  36.11 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  36.52 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.32 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  47.06 
 
 		 917 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.53 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  50.63 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 509 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  42.53 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.48 
 
 		 914 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  42.86 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.95 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.76 
 
 		 894 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.16 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.16 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.16 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 922 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 855 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>