196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1331 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  70.33 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  69.68 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  57.4 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  54.84 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  56.6 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  54.61 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  55.6 
 
 		 287 aa  278  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  54.67 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  54.86 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  37.77 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  34.53 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  38.29 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  35.97 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  35.59 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  35.25 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  36.07 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  34.89 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  34.66 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  34.89 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  35.48 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.61 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  36.1 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  35.48 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  34.63 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  34.98 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  34.55 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  32.49 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  35.61 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  30.58 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  33.57 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  34.4 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  30.14 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  33.92 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  34.41 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  31.58 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  34.28 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  34.22 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  31.23 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  32.14 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  35.74 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  34.04 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  32.46 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  29.79 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  34.39 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  34.31 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  33.22 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  36.43 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  31.58 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  34.53 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  34.6 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  34.77 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  34.88 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  33.93 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  31.95 
 
 		 544 aa  132  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  31.37 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  31.07 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  32.82 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  34.66 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  32.82 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  32.82 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  33.59 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  33.59 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  36.5 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  31.58 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  33.46 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  32.82 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  33.46 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  30.5 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  33.22 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  32.95 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  31.82 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  33.21 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  30.68 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  37.26 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  32.69 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  32.18 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  30.94 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  31.12 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  34.09 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  32.14 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  34.33 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  29.13 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  30.8 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  31.3 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  30.58 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  31.7 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>