271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1521 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  67.35 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  67.19 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  63.36 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  62.6 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  57.53 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  54.72 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  46.04 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  42.03 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  44.14 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  38.85 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  38.13 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0021  Mammalian cell entry related domain protein  38.03 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.579673  normal  0.0449568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  39.83 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  39.16 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  39.1 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  34.64 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  34.64 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  36.6 
 
 		 169 aa  83.6  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  34.01 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  34.64 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  36.55 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  32.64 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  33.04 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.79 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  38.73 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  37.04 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  37.04 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  39.64 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  30.14 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  37.07 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  38.66 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  32.45 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  30.82 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  30.61 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  34.86 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  36.45 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  33.64 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.8 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  38.53 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  32.74 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  31.21 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  30.99 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  35.09 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  32.71 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  32.71 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  30.34 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  36.84 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  28.28 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  32.06 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5026  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  30.67 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  28.28 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  36.7 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  31.9 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  36.28 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  35.78 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  30.91 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  33.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  30.84 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  33.64 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  31.37 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  40.86 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  34.51 
 
 		 271 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  32.88 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  30.41 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  32.71 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  28.12 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  32.71 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  30.19 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  32.71 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  32.71 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  30.77 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>