119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2434 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2434  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
785 aa  1590    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00787871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  26.79 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 
1124 aa  62  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 
259 aa  61.6  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.24 
 
 
250 aa  60.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
248 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
277 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25 
 
 
1115 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
1115 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 
305 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 
927 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.57 
 
 
1119 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  27.23 
 
 
254 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 
251 aa  57.4  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 
234 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.54 
 
 
1115 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 
228 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 
365 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 
244 aa  57  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  27.54 
 
 
254 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25.64 
 
 
258 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
254 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.4 
 
 
253 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  26.42 
 
 
234 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.64 
 
 
267 aa  55.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  39.47 
 
 
275 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25 
 
 
234 aa  54.7  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 
256 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.11 
 
 
271 aa  54.7  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  26.38 
 
 
254 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  40.79 
 
 
275 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  22.07 
 
 
321 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  25.94 
 
 
234 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
789 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
789 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
789 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 
286 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 
275 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  24.88 
 
 
321 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.57 
 
 
872 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
254 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.14 
 
 
1115 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
1118 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
234 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 
275 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 
258 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 
238 aa  51.6  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  21.8 
 
 
251 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  33.72 
 
 
238 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  35.37 
 
 
238 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 
345 aa  51.2  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  25.3 
 
 
906 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
197 aa  50.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 
276 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
234 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 
405 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  23.3 
 
 
255 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
234 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
234 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 
413 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 
263 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  25 
 
 
234 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
234 aa  49.3  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  26.32 
 
 
815 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  22.12 
 
 
317 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 
294 aa  48.9  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  21.03 
 
 
295 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  25.22 
 
 
481 aa  48.1  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 
244 aa  48.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  21.27 
 
 
261 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 
302 aa  47.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 
280 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 
705 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  22.86 
 
 
247 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
204 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
280 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  21.69 
 
 
258 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
293 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 
1154 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  20.71 
 
 
404 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.01 
 
 
573 aa  46.2  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.89 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 
227 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  26.17 
 
 
291 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.44 
 
 
260 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 
284 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  25 
 
 
327 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
280 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>