More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13493 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  91.85 
 
 		 195 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  91.85 
 
 		 195 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  91.85 
 
 		 195 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  92.74 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  76.28 
 
 		 203 aa  227  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  89.52 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  64.25 
 
 		 196 aa  218  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  65.75 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  81.36 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  72.18 
 
 		 229 aa  195  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  65.07 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  70.68 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  65.67 
 
 		 268 aa  178  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  70.87 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  67.88 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  61.74 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  72.03 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  66.92 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  66.95 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  68.64 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  54.91 
 
 		 190 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  70.69 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  53.14 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  68.64 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  64.84 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  66.17 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  67.24 
 
 		 222 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  66.39 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  56.52 
 
 		 144 aa  158  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  59.23 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  58.46 
 
 		 180 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  62.33 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  60.16 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  57.86 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  63.56 
 
 		 190 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  56.14 
 
 		 118 aa  134  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  48.37 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  54.39 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.46 
 
 		 140 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 112 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  55.36 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 140 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  51.61 
 
 		 143 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  44 
 
 		 151 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 138 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  45.14 
 
 		 183 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  46.53 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 113 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  50.82 
 
 		 127 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  50.79 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  54.63 
 
 		 131 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  51.82 
 
 		 208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  49.19 
 
 		 141 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  57.69 
 
 		 113 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 136 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  47.79 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 132 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 132 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 132 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 131 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  53.64 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  41.71 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 124 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 		 140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  47.46 
 
 		 124 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 142 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  51.26 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  52.78 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  48.74 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  42.48 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 141 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  52.78 
 
 		 112 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  45.77 
 
 		 156 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  47.54 
 
 		 142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  42.67 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.6 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>