More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12599 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  61.05 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  52.96 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  54.01 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  54.55 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  44.6 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  42.91 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  44.03 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  43.96 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  35.27 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  35.27 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  39.38 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  30.03 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  29.76 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  31.14 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.37 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.75 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  34.71 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  27.12 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  30.1 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.42 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  36.73 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  29.13 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  26.53 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  27.46 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  27.46 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  27.46 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  29.27 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  26.49 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  40.31 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  27.43 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  28.11 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  29.86 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  26.41 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  42.16 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  28.04 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 875 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 861 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  25.32 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.9 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.09 
 
 		 922 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>