198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11731 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  76.63 
 
 
290 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  69.55 
 
 
291 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  32.57 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.89 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.46 
 
 
217 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.3 
 
 
210 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.3 
 
 
210 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.3 
 
 
210 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.3 
 
 
210 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.13 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  23.9 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.3 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.3 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.23 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.3 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.7 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.9 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  23.98 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.9 
 
 
210 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.4 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  34.3 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.4 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  22.09 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.29 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  23.58 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  23.69 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  23.89 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  26.12 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.67 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.06 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.25 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  30.4 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  24.39 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.5 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  30.4 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  27.76 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  24.45 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.69 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  30.08 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  31.14 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.64 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.9 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.11 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  23.29 
 
 
211 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  28.21 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  29.7 
 
 
193 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  24.5 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  28.83 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24.3 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.26 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  29.93 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  27.17 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  27.17 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  28.74 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  31.33 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25 
 
 
215 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  24.39 
 
 
205 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  25.33 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.54 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  25.97 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  31.82 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  31.82 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  22.52 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  26.92 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  31.82 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  28 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  30.23 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  27.27 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  31.82 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  31.82 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  31.82 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  29.69 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  25.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  30.37 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  27.39 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.37 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  31.58 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  24.71 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  31.82 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  24.24 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.78 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  30.83 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  31.48 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  30.53 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  31.17 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  30.07 
 
 
212 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  31.17 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.57 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  27.8 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  25.39 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  31.48 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  27.86 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.95 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  29.41 
 
 
212 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>