More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10456 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  59.38 
 
 
1001 aa  1162    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  61.57 
 
 
962 aa  1162    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  100 
 
 
967 aa  1979    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  60.73 
 
 
957 aa  1155    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  60.86 
 
 
955 aa  1174    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  58.24 
 
 
959 aa  1160    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  64.04 
 
 
968 aa  1254    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  48.29 
 
 
945 aa  954    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  48.29 
 
 
945 aa  954    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  60.86 
 
 
955 aa  1174    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  65.7 
 
 
968 aa  1267    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  64.04 
 
 
968 aa  1254    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  65.41 
 
 
964 aa  1274    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  56.41 
 
 
963 aa  1089    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  58.44 
 
 
968 aa  1163    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  64.22 
 
 
941 aa  1253    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  65.65 
 
 
968 aa  1286    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  61.6 
 
 
944 aa  1203    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  58.19 
 
 
958 aa  1144    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  60.86 
 
 
955 aa  1174    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  60.26 
 
 
968 aa  1126    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  64.04 
 
 
968 aa  1254    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  63.68 
 
 
948 aa  1248    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  31.35 
 
 
945 aa  465  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  64.31 
 
 
397 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  32.21 
 
 
1022 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  32.21 
 
 
1022 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  31.72 
 
 
1003 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  31.54 
 
 
1013 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  31.38 
 
 
1028 aa  429  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  31.21 
 
 
1040 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  29.9 
 
 
1002 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.75 
 
 
998 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.75 
 
 
998 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.75 
 
 
998 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  28.06 
 
 
1146 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  30.25 
 
 
1000 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  29.57 
 
 
1001 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  28.1 
 
 
1089 aa  376  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  29.44 
 
 
1062 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  29.44 
 
 
1062 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  28.25 
 
 
1013 aa  350  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  35.4 
 
 
681 aa  270  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  30 
 
 
1011 aa  237  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  22.17 
 
 
974 aa  229  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.95 
 
 
981 aa  228  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  21.71 
 
 
974 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  39.07 
 
 
1077 aa  211  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  25.61 
 
 
920 aa  193  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  38.03 
 
 
470 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  23.46 
 
 
1109 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  23.81 
 
 
1109 aa  155  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  27.43 
 
 
1041 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  26.84 
 
 
1038 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  27.14 
 
 
1038 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  26.55 
 
 
888 aa  131  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.55 
 
 
1054 aa  131  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  26.55 
 
 
1041 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  27.38 
 
 
1038 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  26.76 
 
 
1038 aa  127  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  27.38 
 
 
1038 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  23.58 
 
 
1002 aa  125  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  29.1 
 
 
753 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  23.61 
 
 
713 aa  124  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  27.25 
 
 
737 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.59 
 
 
1040 aa  118  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  21.34 
 
 
1049 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 
745 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  32.74 
 
 
576 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  24.75 
 
 
1068 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  27.07 
 
 
712 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  27.59 
 
 
730 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  30.53 
 
 
702 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  23.96 
 
 
1246 aa  109  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  31.75 
 
 
750 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  30 
 
 
780 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  23.62 
 
 
1026 aa  107  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  28.34 
 
 
747 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  29 
 
 
699 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  36.63 
 
 
702 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  27.61 
 
 
699 aa  106  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  34.05 
 
 
700 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  28.86 
 
 
712 aa  105  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  31.94 
 
 
764 aa  105  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  25.8 
 
 
836 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  32.93 
 
 
869 aa  102  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  32.68 
 
 
860 aa  100  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.58 
 
 
709 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  31.82 
 
 
699 aa  99.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  28.63 
 
 
674 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  28.63 
 
 
674 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  28.63 
 
 
674 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  30.23 
 
 
727 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 
743 aa  99.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.9 
 
 
682 aa  99  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  33.33 
 
 
713 aa  98.6  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  30.23 
 
 
339 aa  98.2  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  33.33 
 
 
733 aa  98.2  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 
714 aa  98.2  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  31.48 
 
 
701 aa  98.2  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>